Qui Gon Jin élève trés prometteur reçut l'enseignement du comte Dooku qui lui transmit une trés bonne connaissance de la force mais égalemen un caractère très fot qui lui valut d'entrer plusieur fois en conflit avec le conseil Jedi
Le début de la carrière de Qui Gon Jinn en tant que Jedi fut marqué par un terrible échec. Il était parvenu à former un premier padawan avec succès, mais le second, Xanatos fut à l'origine du premier revers pour Qui Gon. Xanatos était le fils de Crion, l'homme le plus riche de la planète Telos. Xanatos était un excellent élève et la force était très présente chez lui. Mais le padawan de Qui Gon avait un caractère particulier. Il était à l'origine de beaucoup de problème au sein du Temple des Jedis. Il avait prit l'habitude de prendre les autres élèves avec « beaucoup de hauteur ». Quand Yoda estima que Xanatos, était fin près pour affronter l'épreuve finale, il envoya Qui Gon Jinn et son padawan sur la planète Telos. Là, Xanatos revît son père qui le supplia de l'aider à faire un coup d'était et de l'aide à prendre les reines du pouvoir. Une guerre civile éclata. Qui Gon témoin du drame qui se passait ici, affronta puis tua Crion. Xanatos, fut témoin de la scène et entreprit immédiatement de tuer celui qui ne considérait même plus comme son maître. Qui Gon, prit le dessus, mais ne put se résoudre à tuer son élève. Celui-ci put s'enfuir. Qui Gon Jinn avait beaucoup de mal à digérer son échec... Il n'acceptait plus d'enseigner aux jeunes padawans qui se présentaient à lui, comme ce fut le cas pour le jeune Obi-Wan Kenobi, sous les conseils de maître Yoda. Puis finalement, il accepta de prendre Obi-Wan comme padawans, grâce à l'insistance de Yoda.
Quelques années plus tard, Qui Gon croisa de nouveau le chemin de Xanatos, sur Bandomeer, il était devenu le chef d'un groupe secret, la Corporation Extérieure. Xanatos tenta de tendre un piège a son ancien maître, mais Obi-Wan, nouveau padawan de Qui Gon, provoqua l'échec du revanchard. Xanatos s'échappa une fois de plus, mais ce nouvel épisode permit à Qui Gon Jinn, d'oublier définitivement ce qui s'était passé quelques années auparavant. La qualité de son jeune apprenti, Kenobi, n'y était pas étrangère.
Finalement, Mace Windu, figure emblématique du Conseil des Jedis, envoya, Qui Gon et Obi-Wan sur Naboo, afin d'y régler une crise économique. Sur cette planète, il sauvera une étrange créature, Jar Jar Binks, un Gungans. Pour le bien de la reine Amidala, ils durent l'amener sur Coruscant, hélas (ou heureusement), le vaisseau qui avait touché par le croiseur de fédération du commerce dut s'arrêter sur Tatooïne. Et c'est ici, que Qui Gon rencontra Anakin Skywalker, « l'élu », selon le vieux maître.
Une fois arrivé à Coruscant, Qui Gon présenta le jeune Anakin a Yoda et au reste du Conseil des Jedis. Mais, Yoda refusa que Qui Gon forme le jeune garçon. Qui Gon affecté par cette décision, se résigna. De retour sur Naboo, pour empêcher l'invasion de la fédération du commerce, Qui Gon et son padawan tombèrent nez à nez avec un Sith du nom de Dark Maul. Le combat commença et le Jedi noir qui n'éprouvait pas trop de difficulté à parer les attaques des deux Jedis réussit à les séparer, il put attaque le vieux maître Jedi dans un combat singulier et le tua. Qui Gon ne put voir que son élève, Obi-Wan Kenobi, le venger avant qui ne puisse lui souffle quelques mots : Obi-Wan Kenobi devra former Anakin Skywalker.